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講義概要/Course Information
2020/04/28 現在

科目基礎情報/General Information
授業科目名
/Course title (Japanese)
生体情報学基礎
英文授業科目名
/Course title (English)
Fundamentals of Information Biology
科目番号
/Code
開講年度
/Academic year
2020年度 開講年次
/Year offered
全学年
開講学期
/Semester(s) offered
前学期 開講コース・課程
/Faculty offering the course
博士前期課程
授業の方法
/Teaching method
講義 単位数
/Credits
2
科目区分
/Category
大学院専門教育科目 - 専門科目Ⅰ
開講学科・専攻
/Cluster/Department
基盤理工学専攻
担当教員名
/Lecturer(s)
松田 信爾
居室
/Office
東6号館716号室 Building E-6 room 716
公開E-Mail
/e-mail
smatsuda@uec.ac.jp
授業関連Webページ
/Course website
特になし Not in particular
更新日
/Last updated
2020/02/25 10:44:47 更新状況
/Update status
公開中
/now open to public
講義情報/Course Description
主題および
達成目標
/Topic and goals
<主題>
生命システムと情報というテーマについて、主に2つの観点から講義を行う。
1)生命システムにおける「情報」を受容・処理・伝達のメカニズム
2)生命システムがもつ「情報」の測定法や制御法

<到達目標>
生体システムにおける情報処理メカニズムの原理を理解すること。

This course introduces how organisms process the information.
This course also introduces the method to study or to control the information processing of organisms.

The goal of the course is to understand the molecular mechanism of information processing of organisms.

前もって履修
しておくべき科目
/Prerequisites
特になし Not in particular
前もって履修しておくこ
とが望ましい科目
/Recommended prerequisites and preparation
特になし Not in particular
教科書等
/Course textbooks and materials
<教科書> 特に指定しない。
<参考書> Eric R. Kandel著「カンデル神経科学」メディカルサイエンスインターナショナル
<Text Book>Not in particular
<Reference Book> Principles of neuronal science, Eric R. Kandel
授業内容と
その進め方
/Course outline and weekly schedule
TypeⅡ:Japanese-based course, with English materials

第1回.イントロダクション、生体情報の概観
Introdcuction, overview of biological information
第2回.生体分子レベルでの情報処理1(DNA, RNA, 遺伝子発現について学ぶ)
Information at the molecular level 1 (DNA, RNA , gene expression)
第3回.生体分子レベルでの情報処理2(蛋白質, 翻訳後修飾, 受容体, イオンチャンネル, G蛋白質について学ぶ)
Information at the molecular level 2 (protein, posttranslational modification, receptor, ion channel, G-protein)
第4回.細胞レベルでの情報処理1(神経細胞, 細胞体, 軸策, 樹状突起, 静止電位, 平衡電位について学ぶ)
Information at the molecular level 1 (neuron, soma , axon, dendrite, resting membrane potential, equilibrium potential)
第5回.細胞レベルでの情報処理2(活動電位, 閾値, 不応期, 跳躍伝導について学ぶ)
Information at the molecular level 2 (action potential, threshold, refractory period, saltatory conduction)
第6回.細胞レベルでの情報処理3(細胞内カルシウムストア, 細胞内情報伝達について学ぶ)Information at the molecular level 3 (intracellular Calcium store, Intracellular signaling)
第7回.細胞レベルでの情報処理4 (エンドサイトーシス, エキソサイトーシスについて学ぶ)Information at the molecular level 4 (endocytosis, exocytosis)
第8回.中間試験とその解説を行う。
Midterm exam and explanation
第9回.組織・器官・器官系レベルでの情報処理1(シナプス, 神経伝達物質, EPSP, IPSP, シナプス可塑性について学ぶ)
Information at the tissue and organ level 1(synapse, neurotransmitter, EPSP, IPSP, synaptic plasticity)
第10回.組織・器官・器官系レベルでの情報処理2(脊椎動物における記憶, 海馬,小脳について学ぶ)
Information at the tissue and organ level 2(memory formation in vertabrate, hippocampus, cerebellum)
第11回.組織・器官・器官系レベルでの情報処理3(視覚, 体性感覚について学ぶ)
Information at the tissue and organ level 3 (visual system, somatic sensation)
第12回.組織・器官・器官系レベルでの情報処理4)(味覚, 嗅覚, 聴覚について学ぶ)
Information at the tissue and organ level 4 (taste, olfaction, audition)
第13回.組織・器官・器官系レベルでの情報処理5(自律神経系, 交感神経,副交感神経について学ぶ)
Information at the tissue and organ level 5 (autonomic nervous system, sympathetic nerve, parasympathetic nerve)
第14回.生体情報測定・制御(パッチクランプ法, バイオイメージング, 光遺伝学, について学ぶ)
Measurement and control of biological imformations (patch clamp, bioimaging, optogenetics)
第15回.期末試験とその解説を行う。
Final exam and explanation
実務経験を活かした
授業内容
(実務経験内容も含む)
/Course content utilizing practical experience
なし
授業時間外の学習
(予習・復習等)
/Preparation and review outside class
予習は特に必要としないが、毎回の講義終了後には講義資料及びノートの復習をして理解を深めておくこと。
Review the lecture to improve understanding
成績評価方法
および評価基準
(最低達成基準を含む)
/Evaluation and grading
<成績評価方法>
以下の3点の評価の総合による。
期末試験(40%)
中間試験(40%)
講義の終わりに行う小テスト(20%)
評価は上記のテストの合計で行う。A:80以上, B:70-79, C:60-69, D:59以下

There will midterm exam(40%) and final (40%)exams. There also will be quizzes after the lecture(20%). The final grade will be determined by the total amount of points  A:over 80, B:70-79, C:60-69, D:under 59.
オフィスアワー:
授業相談
/Office hours
適宜相談に応じるが、電話などで事前にアポイントを取ること。
Make an apointment by e-mail or phone.
学生へのメッセージ
/Message for students
感覚や記憶等の生体情報は私たちの日常生活の基盤となるものです。基礎的なところから大学院で学ぶにふさわしい高度な内容まで幅広く講義したいと考えています。

Biological informations, such as memory formation or emotion, play essential roles for our life. This course will introduce the basic and the latest knowledge about the biological informations.
その他
/Others
重要な発見がどのようになされたかも適宜講義します。今後の研究立案の参考にして下さい。

This course will also introduce how important knowledges were obtained.
キーワード
/Keyword(s)
DNA, RNA, 遺伝子発現, 蛋白質, 翻訳後修飾, 受容体, イオンチャンネル, G蛋白質, 神経細胞, 細胞体, 軸策, 樹状突起, 静止電位, 平衡電位, 活動電位, 閾値, 不応期, 跳躍伝導, 細胞内カルシウムストア, 細胞内情報伝達, エンドサイトーシス, エキソサイトーシス,シナプス, 神経伝達物質, EPSP, IPSP, シナプス可塑性, 海馬,小脳, 視覚, 体性感覚, 嗅覚,聴覚, 味覚, 1次視覚野, 交感神経,副交感神経, 細胞外電極, パッチクランプ法, バイオイメージング, 光遺伝学
DNA, RNA , gene expression, protein, posttranslational modification, receptor, ion channel, G-protein, neuron, soma , axon, dendrite, resting membrane potential, equilibrium potential, action potential, threshold, refractory period, saltatory conduction, intracellular Calcium store, Intracellular signaling, endocytosis, exocytosis, synapse, neurotransmitter, EPSP, IPSP, synaptic plasticity, memory formation in vertabrate, hippocampus, cerebellum, visual system, somatic sensation, taste, olfaction, audition, autonomic nervous system, sympathetic nerve, parasympathetic nerve, patch clamp, bioimaging, optogenetics